More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4003 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0334  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.87 
 
 		 688 aa  801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0366  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.26 
 
 		 688 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0961  methylmalonyl-CoA mutase  60.58 
 
 		 652 aa  737    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  71.23 
 
 		 666 aa  937    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  63.13 
 
 		 671 aa  828    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1226  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  71.06 
 
 		 672 aa  920    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6728  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  67.45 
 
 		 692 aa  900    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  62.4 
 
 		 657 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0797  methylmalonyl-CoA mutase  60 
 
 		 654 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  100 
 
 		 685 aa  1375    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3008  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  60.74 
 
 		 652 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.842553  normal  0.248307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0036  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.47 
 
 		 675 aa  807    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0637775  decreased coverage  0.00272797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0038  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.75 
 
 		 690 aa  808    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579469  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3106  methylmalonyl-CoA mutase  62.88 
 
 		 661 aa  810    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  91.92 
 
 		 668 aa  1168    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  61.69 
 
 		 657 aa  782    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4128  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  73.34 
 
 		 667 aa  953    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  62.37 
 
 		 688 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  69.73 
 
 		 680 aa  920    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1106  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.5 
 
 		 680 aa  809    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0223  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  60.82 
 
 		 647 aa  734    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.784456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  64.97 
 
 		 670 aa  844    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  63.91 
 
 		 667 aa  830    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  60.58 
 
 		 652 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0836  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  60.83 
 
 		 662 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733808  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0290  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  61.72 
 
 		 688 aa  800    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.515512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.63 
 
 		 1081 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  37.95 
 
 		 722 aa  401  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.09 
 
 		 1106 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0079  methylmalonyl-CoA mutase  37.67 
 
 		 706 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.373309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0775  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  43.58 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0288  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.15 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0014  methylmalonyl-CoA mutase  34.95 
 
 		 711 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1860  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.01 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000937746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  35.06 
 
 		 714 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  35.65 
 
 		 712 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0811  methylmalonyl-CoA mutase  37.46 
 
 		 714 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1622  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.09 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  36.9 
 
 		 740 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1855  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  41.92 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  37.01 
 
 		 719 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  36.92 
 
 		 740 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  36.28 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  36.16 
 
 		 713 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  35.41 
 
 		 716 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1549  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.71 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1752  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.78 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1486  methylmalonyl-CoA mutase  40.73 
 
 		 559 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.220657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  34.77 
 
 		 720 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1702  methylmalonyl-CoA mutase  36.12 
 
 		 718 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  35.96 
 
 		 709 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6640  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  34.8 
 
 		 724 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.70273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  35.16 
 
 		 715 aa  379  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  36.07 
 
 		 714 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  37.85 
 
 		 715 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  35.57 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  34.46 
 
 		 720 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  35.96 
 
 		 709 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  35.69 
 
 		 715 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  35.79 
 
 		 720 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  34.8 
 
 		 716 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0281  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.03 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000219849  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  36.01 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  35.69 
 
 		 718 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  35.64 
 
 		 720 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07125  methylmalonyl-CoA mutase  34.96 
 
 		 707 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1283  methylmalonyl-CoA mutase  42.83 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0458  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.36 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484451  normal  0.420898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  35.33 
 
 		 713 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  35.92 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  36.07 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  35.92 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0954  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  39.47 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00417375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0832  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.21 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.682429  normal  0.0142114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.140535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.77 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  35.62 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  36.14 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3688  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  41.55 
 
 		 537 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0115893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  35.17 
 
 		 718 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  35.78 
 
 		 731 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  35.4 
 
 		 738 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  36.12 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  35.16 
 
 		 731 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0930  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  41.89 
 
 		 518 aa  369  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.380206 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  36.01 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  34.92 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22170  methylmalonyl-CoA mutase  36.32 
 
 		 754 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.366718  normal  0.398515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  34.8 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0726  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.33 
 
 		 526 aa  369  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5166  methylmalonyl-CoA mutase  36.88 
 
 		 724 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  34.77 
 
 		 719 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  36.01 
 
 		 720 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5804  methylmalonyl-CoA mutase  34.58 
 
 		 972 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256305  normal  0.17905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  39.53 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2420  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  35.74 
 
 		 763 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3481  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  39.17 
 
 		 551 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4731  methylmalonyl-CoA mutase  36.89 
 
 		 718 aa  364  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>