249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3899 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  93.39 
 
 		 257 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.62 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.08 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.6 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  50.97 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.16 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  50.61 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.6 
 
 		 259 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.2 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.1 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  46.53 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.97 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.43 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.21 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.21 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.42 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.91 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  42.61 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.54 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.18 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.45 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.4 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.29 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  43.61 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.13 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  42.13 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.22 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.1 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  40.27 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.73 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.54 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.04 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.58 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.76 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.64 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.42 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.29 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.27 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.09 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.09 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.37 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.39 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.18 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.62 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.63 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.55 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.94 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.97 
 
 		 264 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  33.98 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  32.68 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.18 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  33.19 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.65 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  34.19 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.19 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.76 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.42 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.8 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.45 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.33 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.18 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.33 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.32 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  39.82 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.06 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  37.02 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.65 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.45 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.39 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  33.33 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  35.88 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.27 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.75 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.18 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.29 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.84 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.44 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.44 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.52 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.05 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.16 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.06 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.41 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.4 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.57 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  38.08 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  34.19 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  38.1 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.44 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.39 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.08 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.19 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.07 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  38.96 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.14 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.1 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.89 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.26 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>