67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3780 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 874 aa  1782    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 		 874 aa  1782    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  43.14 
 
 		 725 aa  333  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  32.63 
 
 		 717 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  33.11 
 
 		 717 aa  261  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  32.82 
 
 		 717 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  32.11 
 
 		 749 aa  251  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  34.68 
 
 		 755 aa  250  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  32.65 
 
 		 738 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  35.92 
 
 		 760 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  36.21 
 
 		 482 aa  241  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  34.87 
 
 		 759 aa  240  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  35.27 
 
 		 765 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  33.18 
 
 		 798 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  33.11 
 
 		 467 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  32.62 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  33.72 
 
 		 882 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  31.87 
 
 		 526 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  30.94 
 
 		 524 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  31.87 
 
 		 526 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.2 
 
 		 782 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  29.93 
 
 		 470 aa  207  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  33.81 
 
 		 485 aa  204  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  34.67 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  34.05 
 
 		 450 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  31.58 
 
 		 746 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  31.58 
 
 		 746 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  33.01 
 
 		 472 aa  197  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  33.18 
 
 		 842 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  31.07 
 
 		 695 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.14 
 
 		 857 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  33.84 
 
 		 479 aa  183  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  26.32 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.21 
 
 		 774 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  30.13 
 
 		 788 aa  164  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.4 
 
 		 757 aa  161  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  25.16 
 
 		 900 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  27.23 
 
 		 554 aa  155  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  31 
 
 		 697 aa  152  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  27.03 
 
 		 770 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  26.56 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  28.57 
 
 		 624 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  28.52 
 
 		 612 aa  127  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  26.38 
 
 		 955 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  28.62 
 
 		 632 aa  115  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  27.58 
 
 		 799 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  38.51 
 
 		 820 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  27.2 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4702  hypothetical protein  28.49 
 
 		 891 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  30.25 
 
 		 1061 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  21.91 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  24.31 
 
 		 486 aa  72  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.1 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  27.65 
 
 		 987 aa  64.3  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.74 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  25.58 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.22 
 
 		 531 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.74 
 
 		 1285 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  26.71 
 
 		 866 aa  59.3  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  20.73 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  20.22 
 
 		 501 aa  53.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  22.06 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  21.32 
 
 		 902 aa  48.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  21.26 
 
 		 771 aa  48.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  29.93 
 
 		 697 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  26.28 
 
 		 1000 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  29.51 
 
 		 978 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>