More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2064 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  74.65 
 
 
435 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  62.47 
 
 
411 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  47.35 
 
 
434 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 
420 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  37.62 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  42.86 
 
 
406 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  42.69 
 
 
402 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  35.34 
 
 
456 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  39.72 
 
 
427 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  38.12 
 
 
418 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  38.12 
 
 
418 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  38.12 
 
 
418 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  38.12 
 
 
417 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  38.12 
 
 
397 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  38.12 
 
 
417 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  38.12 
 
 
397 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
467 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  37.59 
 
 
416 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.24 
 
 
411 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  37.69 
 
 
416 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
418 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
421 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 
420 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  35.49 
 
 
415 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.96 
 
 
402 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  33.18 
 
 
414 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  33.42 
 
 
420 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  34.53 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  33.5 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
439 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
430 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  32.41 
 
 
414 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  39.6 
 
 
289 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 
401 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.07 
 
 
417 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
426 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.78 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.24 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.24 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
444 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
441 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  28.85 
 
 
408 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.93 
 
 
408 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  29.97 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  28.57 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  28.29 
 
 
408 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
414 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  28.29 
 
 
408 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
439 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  33.59 
 
 
408 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  28.01 
 
 
408 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.29 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.58 
 
 
410 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
410 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.83 
 
 
413 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.83 
 
 
413 aa  110  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
415 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.3 
 
 
461 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.25 
 
 
414 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  31.82 
 
 
408 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.69 
 
 
417 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
423 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.87 
 
 
414 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
417 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  31.81 
 
 
420 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
433 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.38 
 
 
406 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
420 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
420 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
432 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
433 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
447 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
406 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.65 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  31 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
458 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.89 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.89 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.89 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  32.86 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
421 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.83 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  25 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.48 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.65 
 
 
404 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>