72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1360 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  38.88 
 
 		 1430 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1247 aa  2456    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  38.84 
 
 		 1303 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  42.39 
 
 		 1201 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  82.03 
 
 		 1248 aa  1930    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  40.4 
 
 		 1363 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  41.18 
 
 		 1272 aa  708    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  40.88 
 
 		 1380 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  40.36 
 
 		 1363 aa  702    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  39.2 
 
 		 1601 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  37.13 
 
 		 1299 aa  636  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  36.38 
 
 		 1299 aa  632  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  39.06 
 
 		 1736 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  40.6 
 
 		 1973 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  40.75 
 
 		 1308 aa  302  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 734 aa  253  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  25.72 
 
 		 706 aa  108  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  24.38 
 
 		 840 aa  99  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  27.63 
 
 		 631 aa  92.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  23.9 
 
 		 661 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  33.05 
 
 		 625 aa  89.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  24.5 
 
 		 677 aa  89  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.63 
 
 		 2068 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  25.16 
 
 		 676 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  24.46 
 
 		 872 aa  77.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  23.75 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  32.43 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  32.02 
 
 		 620 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  27.66 
 
 		 698 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  26.37 
 
 		 799 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  27.7 
 
 		 523 aa  70.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  26.63 
 
 		 798 aa  70.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  31.49 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  26.18 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.63 
 
 		 625 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  25.12 
 
 		 798 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  25.68 
 
 		 779 aa  67.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.8 
 
 		 649 aa  62  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  30.34 
 
 		 3507 aa  61.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  30.72 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  28.4 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.13 
 
 		 1042 aa  58.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  25.57 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.99 
 
 		 795 aa  56.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  26.62 
 
 		 643 aa  55.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.8 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  55.81 
 
 		 679 aa  53.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 		 528 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  28.05 
 
 		 687 aa  53.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  34.44 
 
 		 836 aa  53.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  37.9 
 
 		 14944 aa  53.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  33.92 
 
 		 1633 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  30.51 
 
 		 645 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.38 
 
 		 9585 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  33.73 
 
 		 340 aa  50.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.27 
 
 		 1462 aa  50.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  30.39 
 
 		 211 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  25.15 
 
 		 527 aa  50.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  26.84 
 
 		 536 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  26.71 
 
 		 512 aa  49.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 3333 aa  48.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  26.06 
 
 		 877 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  26.83 
 
 		 536 aa  48.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  30.89 
 
 		 995 aa  48.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  25.61 
 
 		 895 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 776 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  27.44 
 
 		 496 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 999 aa  47  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  26.2 
 
 		 2334 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 		 861 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  26.63 
 
 		 444 aa  45.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>