147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1343 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  63.57 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  55 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  47.69 
 
 		 284 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  49.14 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  46.72 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.18 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  46.41 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  47.54 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  50.98 
 
 		 294 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.7 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  47.79 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  51.15 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  51.15 
 
 		 318 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  45.96 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  47.52 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  44.53 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  46.18 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  44.14 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  47.81 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  43.19 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  44.05 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  50.23 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  41.8 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  46.05 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  41.6 
 
 		 689 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  43.95 
 
 		 688 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  43.55 
 
 		 690 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  44.64 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  40.8 
 
 		 689 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  41.2 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  39.61 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  43.15 
 
 		 687 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  45.5 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  39.61 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  45 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  43.78 
 
 		 688 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  39.44 
 
 		 450 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  43.56 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  37.84 
 
 		 688 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  41.05 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  37.69 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  40.34 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  36.94 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  36.94 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  38.3 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  36.51 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  34.15 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  39.2 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  30.24 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  30.24 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  30.24 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  29.25 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  29.84 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  29.84 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  29.84 
 
 		 232 aa  92.8  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.04 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  29.03 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  29.15 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  26.14 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  30.49 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  29.22 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  27.27 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  29.68 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  26.46 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  27.85 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  29.82 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  28.33 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  29.44 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  25.57 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  26.92 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  26.61 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  31.72 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  25.74 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  25.32 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  26.61 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  26.81 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  26.61 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  27.04 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  28.21 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.29 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  28.63 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  26.92 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  26.72 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  25 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  24.58 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.41 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0932  cytochrome c1  26.69 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  26.32 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0823  cytochrome c1  27.47 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.862192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  26.64 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  23.83 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1202  cytochrome c1  26.16 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  25 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.8 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  25.44 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  25.11 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1003  cytochrome c1  27.23 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0835319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  24.11 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  24.56 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>