More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1699 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1142    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 577 aa  621  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 577 aa  618  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 572 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 565 aa  607  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 576 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 570 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 573 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 573 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 576 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 571 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 575 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 573 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 580 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 574 aa  568  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 569 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 570 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 574 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 570 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 564 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 566 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 566 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 574 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 570 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 582 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 570 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 566 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 566 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 565 aa  551  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1325  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 567 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000449091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 574 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 579 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1387  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 566 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0647  prolyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.785979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 575 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1050  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 566 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0897  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 569 aa  538  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.365836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  49.72 
 
 		 572 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0765  prolyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 567 aa  534  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0150989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0368  prolyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 569 aa  529  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.014128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0568  prolyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 569 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.418089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  48.5 
 
 		 575 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 570 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 567 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 578 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 573 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 578 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0769  prolyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 565 aa  524  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 578 aa  525  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 569 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 578 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23550  prolyl-tRNA synthetase, family II  46.71 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000284536  hitchhiker  0.0091674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 573 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0350  prolyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.918323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 578 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0104  prolyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 578 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 580 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0689  prolyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 574 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 576 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 568 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>