More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1147 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  100 
 
 		 487 aa  959    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  59.5 
 
 		 510 aa  551  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  55.35 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  44.17 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  42.98 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  40.49 
 
 		 534 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  34.37 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  34.69 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  38.1 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  39.69 
 
 		 523 aa  272  9e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  39.25 
 
 		 523 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.57 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  36.45 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  36.2 
 
 		 512 aa  262  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  34.27 
 
 		 563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  34.79 
 
 		 533 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  32.6 
 
 		 518 aa  216  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  29.98 
 
 		 528 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  31.28 
 
 		 538 aa  206  8e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  34.23 
 
 		 539 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  31 
 
 		 528 aa  204  4e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  34.13 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  30.9 
 
 		 463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  34.08 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  33.25 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  33.94 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  33.94 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  33.25 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  33.94 
 
 		 473 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  32.45 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  34.45 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  35.2 
 
 		 428 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  34.55 
 
 		 455 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  34.14 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  32.32 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  32.15 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  32.15 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  35.1 
 
 		 456 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  36.36 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  33.86 
 
 		 468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  32.91 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.41 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.34 
 
 		 859 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  34.57 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  32.14 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  31.59 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  33.09 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.79 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  31.84 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.52 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  33.52 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.52 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  31.91 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.15 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  31.43 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  32.63 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  30.83 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  29.97 
 
 		 455 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  34.36 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.58 
 
 		 472 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.77 
 
 		 863 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  34.53 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  24.22 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.13 
 
 		 862 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.91 
 
 		 436 aa  117  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.04 
 
 		 606 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  28.91 
 
 		 559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  29.05 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.18 
 
 		 591 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.17 
 
 		 598 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.54 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  30.45 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  31.22 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.86 
 
 		 897 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.22 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  31.04 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.62 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  29.54 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.24 
 
 		 754 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.47 
 
 		 628 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  30.39 
 
 		 513 aa  107  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  30.06 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.25 
 
 		 636 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.51 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29 
 
 		 579 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.33 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  28.35 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  30.06 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.44 
 
 		 589 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  28.74 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>