More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0586 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0586  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.58 
 
 
333 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109315  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0591  ABC transporter related  39.34 
 
 
321 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.91 
 
 
353 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0476  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
340 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  35.29 
 
 
302 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5083  ABC transporter related  26.57 
 
 
320 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16913  hitchhiker  0.000556999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  29.59 
 
 
275 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.14 
 
 
342 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  36.13 
 
 
243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.39 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  25.93 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1055  ABC transporter related  33.18 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.758916  normal  0.126684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  33.04 
 
 
580 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
580 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1429  ABC transporter related  25.52 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.152844  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  35.38 
 
 
251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  32.88 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  31.34 
 
 
593 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  31.93 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  31.51 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
300 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 
300 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.13 
 
 
314 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  33.17 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  32.2 
 
 
599 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  32.93 
 
 
300 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.46 
 
 
322 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39708  predicted protein  33.46 
 
 
1883 aa  125  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.405185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.73 
 
 
325 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  31.39 
 
 
582 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  33.03 
 
 
243 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
300 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  30.49 
 
 
585 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  31.7 
 
 
580 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  31.53 
 
 
338 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  30.91 
 
 
339 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  30.91 
 
 
339 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  30.45 
 
 
282 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3360  ABC transporter related  31.84 
 
 
250 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.88 
 
 
339 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  31.08 
 
 
512 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  31.28 
 
 
241 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  32.88 
 
 
307 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
583 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
300 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.84 
 
 
312 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1408  ABC transporter related  32.7 
 
 
303 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.021534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.28 
 
 
338 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  30.67 
 
 
576 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  32 
 
 
589 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  25.26 
 
 
337 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
300 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.04 
 
 
350 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  31.63 
 
 
247 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 
300 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  31.78 
 
 
320 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  29.66 
 
 
287 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
238 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000146773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  34.43 
 
 
309 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  29.63 
 
 
510 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  33.18 
 
 
339 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  31.43 
 
 
250 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  31.08 
 
 
338 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.59 
 
 
309 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  29.68 
 
 
312 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  32.58 
 
 
904 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
253 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  31.63 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  32.55 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
245 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.76 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  32.42 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  28.44 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  30.91 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.74 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  31.78 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  31.98 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  30.63 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  29.55 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  32 
 
 
593 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  32.81 
 
 
583 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  31.51 
 
 
308 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  31.9 
 
 
308 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  25.74 
 
 
321 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
249 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  32.55 
 
 
339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.37 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  32.24 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  34.1 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  33.63 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  32.57 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>