More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39708 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39708  predicted protein  100 
 
 
1883 aa  3880    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.405185  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_23497  predicted protein  28.88 
 
 
1891 aa  540  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42103  ABC(ATP-binding) family transporter  30.71 
 
 
1226 aa  271  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166966  normal  0.134886 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08812  ABC transporter (Eurofung)  31.78 
 
 
1626 aa  202  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
310 aa  163  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
275 aa  160  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 
279 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 
313 aa  155  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
241 aa  154  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.22 
 
 
295 aa  154  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15212  predicted protein  40.31 
 
 
475 aa  154  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  38.59 
 
 
332 aa  154  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.83 
 
 
316 aa  153  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.96 
 
 
313 aa  152  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.71 
 
 
321 aa  152  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.16 
 
 
310 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.39 
 
 
319 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  35.79 
 
 
303 aa  150  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
308 aa  149  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  35 
 
 
279 aa  149  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  34.26 
 
 
309 aa  149  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.36 
 
 
279 aa  149  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  31.83 
 
 
316 aa  148  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.66 
 
 
308 aa  148  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.66 
 
 
308 aa  147  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.12 
 
 
310 aa  147  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.3 
 
 
337 aa  147  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
331 aa  147  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.89 
 
 
319 aa  147  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  33.33 
 
 
310 aa  146  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.24 
 
 
308 aa  145  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  37.61 
 
 
305 aa  145  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.75 
 
 
322 aa  145  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  34.41 
 
 
246 aa  145  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  35.37 
 
 
299 aa  145  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  37.66 
 
 
310 aa  145  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.11 
 
 
312 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.19 
 
 
305 aa  145  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
287 aa  144  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  33.2 
 
 
303 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
312 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  40.17 
 
 
318 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
311 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 
359 aa  144  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.95 
 
 
329 aa  144  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  36.88 
 
 
279 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  36.16 
 
 
302 aa  144  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.52 
 
 
322 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  38.29 
 
 
276 aa  144  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  36 
 
 
275 aa  143  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.98 
 
 
304 aa  143  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
343 aa  143  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.68 
 
 
316 aa  143  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.76 
 
 
301 aa  143  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  34.96 
 
 
241 aa  142  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  32.9 
 
 
306 aa  143  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
308 aa  143  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
325 aa  143  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  32.4 
 
 
319 aa  143  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.57 
 
 
311 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  31.77 
 
 
313 aa  142  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.53 
 
 
320 aa  142  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.33 
 
 
309 aa  142  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.93 
 
 
324 aa  142  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  32.26 
 
 
318 aa  142  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.73 
 
 
328 aa  141  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
307 aa  141  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  40.19 
 
 
373 aa  141  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
308 aa  141  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  34.98 
 
 
309 aa  141  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0503  ABC transporter related  40.93 
 
 
296 aa  141  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  38.84 
 
 
322 aa  141  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  37.72 
 
 
307 aa  141  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.65 
 
 
320 aa  141  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  32.23 
 
 
300 aa  141  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  37.61 
 
 
311 aa  141  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  39.81 
 
 
323 aa  141  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0909  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
275 aa  141  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000694874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
446 aa  140  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 
368 aa  140  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  33.09 
 
 
282 aa  141  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.18 
 
 
331 aa  140  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.05 
 
 
304 aa  140  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.48 
 
 
345 aa  140  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  40.83 
 
 
304 aa  140  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  33 
 
 
306 aa  140  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  32.79 
 
 
309 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35 
 
 
297 aa  140  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  30.65 
 
 
318 aa  140  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.74 
 
 
326 aa  140  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  32 
 
 
330 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  31.79 
 
 
283 aa  140  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
300 aa  139  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
317 aa  139  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.89 
 
 
339 aa  139  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 
362 aa  139  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.88 
 
 
330 aa  139  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 
312 aa  139  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  36.28 
 
 
284 aa  139  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
315 aa  139  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>