More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2824 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5083  ABC transporter related  42.86 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16913  hitchhiker  0.000556999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1429  ABC transporter related  41.58 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.152844  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0591  ABC transporter related  36.89 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0476  ABC transporter related protein  38.99 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1055  ABC transporter related  39.27 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.758916  normal  0.126684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  45.33 
 
 		 756 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.36 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.19 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.18 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.74 
 
 		 741 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  42.22 
 
 		 912 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.79 
 
 		 906 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  40.79 
 
 		 906 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 242 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 341 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  41.42 
 
 		 912 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  41.33 
 
 		 912 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  39.91 
 
 		 906 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.67 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.18 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.96 
 
 		 906 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.16 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  41.7 
 
 		 917 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.92 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.57 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.98 
 
 		 907 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.97 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0586  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  36.16 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  38.26 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  40.57 
 
 		 932 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  34.07 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  35.74 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.83 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  36.84 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.16 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.19 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 333 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  32.98 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  42.92 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  40.35 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  34.98 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  39.5 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 241 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.73 
 
 		 360 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  40.3 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  40.71 
 
 		 916 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36.52 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  36.24 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  34.65 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.86 
 
 		 411 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  35.86 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  33.86 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  38.99 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.39 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.55 
 
 		 914 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  36.96 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  39.47 
 
 		 510 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.74 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  37.46 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  43.37 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  38.57 
 
 		 912 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.93 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.27 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  37.07 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.3 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  39.41 
 
 		 904 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.56 
 
 		 240 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  39.83 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 248 aa  142  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  34.19 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  33.77 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  36 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.7 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  33.66 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  36.33 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.96 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>