253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2086 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 220 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  72.15 
 
 		 223 aa  350  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  72.15 
 
 		 223 aa  350  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  58.53 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  56.95 
 
 		 227 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  56.05 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  56.31 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  56.31 
 
 		 227 aa  256  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  56.31 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  56.31 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  56.42 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  56.42 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  53.95 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  53.95 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  49.54 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  46.12 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  46.85 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  48.85 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  44.7 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  45.16 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  42.2 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  43.32 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  39.05 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  42.36 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  39.73 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  43.87 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  44.34 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  34.22 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  36.28 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  34.27 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  34.74 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  32.41 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  32.31 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  34.29 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  34.97 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  34.12 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  36.62 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  31.6 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  33.96 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  33.18 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  31.13 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  32.23 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  30.7 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  32.12 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  31.28 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  27.31 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  33.93 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  32.09 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  33.02 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  33.02 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  34.09 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  32.54 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  31.7 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  34.16 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  30.26 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  31.61 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  31.9 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  34.36 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  32.68 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  31.61 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  31.09 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  32.52 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  31.09 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.17 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  29.9 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.72 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  30.14 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  32.2 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.32 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  30.53 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.09 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  30.52 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  31.18 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  31.86 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  29.33 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  27.75 
 
 		 237 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.05 
 
 		 199 aa  88.2  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.29 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  27.19 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  25.62 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  28.84 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  28.42 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  30.2 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  27.31 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  25.62 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  28.44 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  28.16 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  26.09 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  29.65 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  27.57 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  32.84 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.7 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  31.31 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.71 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  32.84 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>