More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2098 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
659 aa  1356    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  60.12 
 
 
656 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  76.71 
 
 
647 aa  1045    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  47.19 
 
 
668 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  47.66 
 
 
648 aa  608  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  46.64 
 
 
647 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  46.86 
 
 
619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  45.24 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  46.02 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  46.19 
 
 
647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  45.25 
 
 
644 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  45.21 
 
 
649 aa  582  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 
647 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  46.64 
 
 
647 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  45.32 
 
 
647 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  46.07 
 
 
626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  44.04 
 
 
669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  46.07 
 
 
626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  44.85 
 
 
645 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  43.28 
 
 
630 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 
630 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  36.51 
 
 
585 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.87 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 
612 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.91 
 
 
680 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.43 
 
 
640 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.18 
 
 
644 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.48 
 
 
622 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  35.51 
 
 
665 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.79 
 
 
612 aa  388  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.87 
 
 
603 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.76 
 
 
628 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  36.47 
 
 
674 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 
620 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 
674 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 
692 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.91 
 
 
631 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 
647 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  33.48 
 
 
695 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 
605 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 
606 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.17 
 
 
632 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  31.52 
 
 
670 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 
608 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.58 
 
 
589 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 
602 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.34 
 
 
586 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 
605 aa  352  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.71 
 
 
605 aa  350  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 
599 aa  349  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  34.15 
 
 
621 aa  347  6e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  31.26 
 
 
630 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  34.46 
 
 
617 aa  338  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 
650 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  31.82 
 
 
603 aa  334  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.95 
 
 
647 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 
644 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 
588 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  31.4 
 
 
584 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.74 
 
 
626 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 
601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.22 
 
 
629 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.76 
 
 
628 aa  325  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 
624 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  32.48 
 
 
623 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 
589 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  32.05 
 
 
608 aa  323  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 
607 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 
655 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  29.61 
 
 
607 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  29.82 
 
 
608 aa  317  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
644 aa  317  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.36 
 
 
636 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  30.25 
 
 
628 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 
610 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 
652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 
648 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 
626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  30.69 
 
 
605 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.75 
 
 
630 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.33 
 
 
624 aa  312  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 
641 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 
632 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  31.17 
 
 
597 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  30.83 
 
 
691 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  30.35 
 
 
616 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  31 
 
 
641 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  30.83 
 
 
602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  31.19 
 
 
685 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  29.29 
 
 
692 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
620 aa  306  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.14 
 
 
661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  31.14 
 
 
687 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 
671 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 
595 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  31.18 
 
 
625 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  29.46 
 
 
647 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 
681 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  30.64 
 
 
603 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>