259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1345 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  45.6 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  46.24 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  44.97 
 
 		 462 aa  154  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  42.55 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  46.5 
 
 		 464 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  45.91 
 
 		 464 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  46.6 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  47.18 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  46.6 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  41.11 
 
 		 471 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  40.64 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  41.53 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  42.02 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  41.53 
 
 		 240 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  47.22 
 
 		 502 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  43.33 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  40.66 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  45.26 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  37.3 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  42.78 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  39.78 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  38.55 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  39.23 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  41.9 
 
 		 708 aa  121  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  39.52 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  36.46 
 
 		 199 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  41.57 
 
 		 427 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  36.6 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  33.86 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  39.78 
 
 		 447 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 		 1015 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 1001 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  34.06 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 252 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  36.27 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  32.48 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  31.28 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  34.51 
 
 		 6999 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  31.62 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 		 8211 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  29.91 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.09 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 264 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.78 
 
 		 235 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  33.87 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  26.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.5 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.34 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.88 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  33.65 
 
 		 3761 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.04 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2839  methyltransferase type 12  31.86 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323425  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  38.02 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  27.84 
 
 		 2012 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 		 3639 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  26.92 
 
 		 238 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 274 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  34.83 
 
 		 290 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.29 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  28 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  25.81 
 
 		 2997 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  31.36 
 
 		 354 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.04 
 
 		 7541 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 349 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  35.05 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  32.23 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  33.6 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  28.43 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  30.47 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  30.3 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  34.83 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.88 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  34.83 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  27.78 
 
 		 1287 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 339 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  33.71 
 
 		 290 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>