155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0297 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 427 aa  815    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  53.1 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  45.39 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  45.95 
 
 		 433 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  42.49 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  28.14 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  27.34 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.5 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.89 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.83 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  27.09 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.94 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  23.73 
 
 		 468 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.76 
 
 		 403 aa  93.6  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.94 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.88 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  23.96 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  25.61 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.94 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  23.38 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.69 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  25.68 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  29.57 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  23.99 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  22.94 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.75 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  23.5 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  25.06 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  27.96 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  29.81 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  29.59 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  23.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  22.92 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  23.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  28.73 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  25 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  26.76 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  26.89 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  28.35 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  25.75 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.25 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  23.99 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  22.33 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  27.95 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  27.95 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  26.44 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  26.46 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  27.56 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  24.05 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  28.34 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  24 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  27.56 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  26.56 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  24.11 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  23.81 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  25.6 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  22.26 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  22.26 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.7 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  26.79 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.15 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  26.82 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  24.6 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  23.81 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  20.2 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  22.64 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  21.77 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  22.09 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  24.55 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.15 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  22.14 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  19.57 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  24.83 
 
 		 542 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  26.88 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3070  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.94 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  25.75 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  25.4 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  21.4 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  23.68 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  21.61 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  21.43 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  21.53 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  21.53 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  21.53 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  23.86 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.53 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  26.27 
 
 		 553 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.98 
 
 		 625 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  22.54 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  21.54 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  20.53 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  23.68 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  25.49 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  23.4 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  23.61 
 
 		 463 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  22.73 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  23.98 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>