More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1121 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  96.37 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  78.63 
 
 		 257 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  77.82 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  66.94 
 
 		 245 aa  337  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  65.32 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  62.75 
 
 		 257 aa  317  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  64.17 
 
 		 245 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  62.35 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  59.09 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  56.22 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  56.97 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  57.54 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  50.59 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  46.18 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  47.15 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  47.27 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.53 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  45.64 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  47.98 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  44.71 
 
 		 260 aa  209  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.6 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  43.51 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  45.96 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.18 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 363 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 238 aa  203  3e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  43.1 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  43.58 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  43.1 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  43.03 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  41.87 
 
 		 359 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  41.91 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  41.31 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  42.26 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  42.26 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.55 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  43.03 
 
 		 363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  42.74 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  44.53 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 357 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.24 
 
 		 333 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  45.64 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  43.39 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.43 
 
 		 362 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 359 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.42 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  43.57 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.02 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.02 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.02 
 
 		 361 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  42.11 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  42.11 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40.16 
 
 		 333 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  42.15 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  42.32 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.74 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  41.91 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.56 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  38.46 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.15 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  41.13 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  41.94 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  42.02 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.56 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41.49 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  41.43 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  40.96 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  43.15 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  41.74 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>