More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2215 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2215  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  96.6 
 
 		 235 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  96.6 
 
 		 235 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  77.16 
 
 		 233 aa  363  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4014  two component transcriptional regulator  76.5 
 
 		 234 aa  363  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0111  two component transcriptional regulator  75.86 
 
 		 239 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.61 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  43.88 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3588  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.73 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  40.26 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  35 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  38.14 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.09 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  38.4 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 241 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  37.97 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.33 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  37.39 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  33.05 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.71 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  33.05 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  36.6 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  36.78 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.68 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  36.4 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  37.97 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  35.8 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>