99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2075 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  91.6 
 
 		 406 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  91.36 
 
 		 406 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  70.2 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  66.83 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  63.54 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  64.69 
 
 		 408 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  43.31 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 410 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 401 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  43.25 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.6 
 
 		 420 aa  262  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  42.52 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  35.13 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  42.25 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  37.67 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  37.5 
 
 		 399 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 		 409 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  38.19 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  36.74 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  39.85 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  36.69 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 419 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  34.15 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  35.79 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  31.05 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  37.84 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  31.67 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  31.25 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  37.73 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  32.24 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 420 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  27.2 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  29.35 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  29.19 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  29.35 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  29.8 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  29.92 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  29.8 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.42 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  28.71 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  31 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  40.38 
 
 		 205 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  34.13 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  28.39 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.42 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>