More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1066 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  96.37 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  96.37 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  79.03 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  78.23 
 
 		 252 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  67.74 
 
 		 245 aa  344  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  63.16 
 
 		 257 aa  321  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  64.92 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  63.33 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  62.35 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  58.68 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  58.17 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  55.82 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  57.94 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  50.99 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.78 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  47.15 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  48.44 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  48.79 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  45.49 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  47.66 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.2 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  45.17 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.72 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  47.01 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.98 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.57 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  43.93 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 363 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  42.47 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  43.97 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  42.75 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  42.75 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 296 aa  197  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  43.03 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  43.51 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  42.91 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  41.87 
 
 		 359 aa  191  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  43.98 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  45.23 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  42.26 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.15 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  42.11 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  42.74 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 421 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.98 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  42.5 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.84 
 
 		 333 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.15 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.98 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.42 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  42.21 
 
 		 363 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  42.44 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  42.23 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.74 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41.49 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  41.32 
 
 		 397 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  40.96 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  40.96 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  46.06 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 357 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  41.41 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.02 
 
 		 362 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  41.74 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.91 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  42.74 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.02 
 
 		 361 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.02 
 
 		 361 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.34 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  41.94 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  41.91 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>