288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3249 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  45.2 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  45.24 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  48.77 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  43.48 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  39.67 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  49.38 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  37.19 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  37.75 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  37.75 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  43.62 
 
 		 269 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  37.75 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  37.97 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  38.42 
 
 		 256 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  43.17 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  40.83 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  40.12 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  37.63 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  36.18 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  40.11 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  41.28 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  38.07 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  37.97 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  35.47 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 269 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  29.06 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  34.91 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  34.91 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 262 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  32.32 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  30.6 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 240 aa  95.9  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.69 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  29.23 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  34.29 
 
 		 275 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 263 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.07 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  33.91 
 
 		 255 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 		 293 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  31.36 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.94 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.08 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 		 339 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.58 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 349 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  37.4 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  29.03 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  28.9 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  28.23 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 671 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.17 
 
 		 671 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.67 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.98 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>