79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1229 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  872    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  37.7 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  37.6 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  33.99 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  32.49 
 
 		 945 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  32.07 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  31.7 
 
 		 454 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  30.33 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  30.57 
 
 		 513 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  30.33 
 
 		 513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  30.5 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  32.28 
 
 		 1175 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  29.25 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  32.97 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.33 
 
 		 1844 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  31.9 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  31.82 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.59 
 
 		 998 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  28.31 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  30.37 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  30.65 
 
 		 699 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  31.04 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  28.29 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.81 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.43 
 
 		 494 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 3977 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  30.05 
 
 		 2852 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  28.33 
 
 		 501 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.99 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  25.25 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.69 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  25.32 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  26.74 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.81 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.41 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  27.98 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 854 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  26.64 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  24.8 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  27.57 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.52 
 
 		 769 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  29.27 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  25.57 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  25.27 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  30.77 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 1016 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  25.82 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  32.41 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  27.82 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.76 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  27.1 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  27.32 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  28.14 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  29.2 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  27.66 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  26.8 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  25.24 
 
 		 719 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  30.07 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  28.19 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.3 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  27.66 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  24.62 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  31.29 
 
 		 732 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  29.7 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  30 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  30.61 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  28 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  22.37 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  26.32 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  26.88 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  22.3 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  25.18 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  27.33 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  27.61 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  26.28 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>