More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0508 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  100 
 
 		 294 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  47.87 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  48.41 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  47.87 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  49.64 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  46.45 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  45.91 
 
 		 307 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  50.18 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  46.26 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  50.18 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  46.29 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  46.45 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  45.45 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  45.55 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  48 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  46.1 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  41.94 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  44.13 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  38.08 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  41.81 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  42.29 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  42.29 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  34.35 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  32.64 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  31.79 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.09 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  32.6 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.32 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  28.82 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.21 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  30.53 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  26.9 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  28.62 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  26.45 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  29.25 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  25.26 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  27.36 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.2 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  28.43 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.43 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  28.76 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  27.68 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  24.57 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  25.98 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  25.52 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  25.83 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  30.35 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0740  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.34 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  28.25 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  26.83 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.23 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  27.49 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>