126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5117 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  83.59 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  86.49 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  78.64 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  76.7 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  76.7 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  71.43 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  66.09 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  66.67 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  58.59 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  60.5 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  66.96 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  63.11 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  60.19 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  57.01 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  51.35 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  51.35 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  42.06 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  41.32 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  34.78 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.82 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  36.22 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.91 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  36.52 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.3 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 		 613 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.96 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  33.96 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33.94 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  37.27 
 
 		 593 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 590 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  29.31 
 
 		 539 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.55 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.07 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32.82 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.58 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  32.95 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.65 
 
 		 424 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 564 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  30.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 565 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  27.42 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 560 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  27.03 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 869 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  29.75 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  31.48 
 
 		 210 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  29.75 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  32.18 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.81 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  30.19 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  29.51 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  31.18 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  29.51 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>