More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1034 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  85.6 
 
 		 257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  87.94 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  87.16 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.32 
 
 		 257 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.82 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.21 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  78.21 
 
 		 257 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  86.38 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  81.71 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  79.77 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  71.98 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.04 
 
 		 257 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  55.73 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  50.39 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  51.22 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  47.29 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  46.9 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.67 
 
 		 174 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.75 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  32.69 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 246 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.11 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.42 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  33.08 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.42 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.78 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.05 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  32.16 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>