232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2594 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  85.95 
 
 		 478 aa  862    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  100 
 
 		 478 aa  981    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  50 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  42.32 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  42.32 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  40.83 
 
 		 478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  40.67 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  40.83 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  40.83 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  40.62 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  40.42 
 
 		 478 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  39.96 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  41.37 
 
 		 491 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  40.29 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  39.51 
 
 		 490 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  39.63 
 
 		 485 aa  333  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  39.63 
 
 		 482 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  39.63 
 
 		 482 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  39.63 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  39.63 
 
 		 482 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  40.25 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  39.22 
 
 		 490 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  39.01 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  39.84 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  35.21 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  48.59 
 
 		 418 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  30.06 
 
 		 524 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  33.21 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  31 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  30.02 
 
 		 527 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  30.57 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  30.36 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  30.45 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  30.29 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  28.9 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  26.82 
 
 		 523 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 526 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  29.88 
 
 		 541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  30.61 
 
 		 530 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  29.73 
 
 		 532 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  29.67 
 
 		 535 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  28.84 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  30 
 
 		 519 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  28.69 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  30.04 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  28.07 
 
 		 528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  27.33 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  30.36 
 
 		 520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  28.25 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  28.7 
 
 		 527 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  27.8 
 
 		 536 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  28.25 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  27.58 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  26.45 
 
 		 557 aa  136  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  28.9 
 
 		 535 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  26.38 
 
 		 557 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.3 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  25.49 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  25.65 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.03 
 
 		 495 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  25.77 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  27.49 
 
 		 544 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  27.49 
 
 		 559 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  24.46 
 
 		 698 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  23.46 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  27.36 
 
 		 560 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  26.1 
 
 		 685 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  26.22 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  25.35 
 
 		 576 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  25.71 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  26.46 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  26.22 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  26.13 
 
 		 566 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.18 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.29 
 
 		 459 aa  86.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  25.09 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27.43 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  31.12 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  25.85 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.68 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  27.75 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  27.08 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.73 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  22.95 
 
 		 646 aa  73.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  23.39 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.42 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  30.73 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  23.88 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  27.11 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  25.97 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.18 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.18 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.39 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.13 
 
 		 525 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.91 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  40.74 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  24.78 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  22.2 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.39 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  23.34 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>