77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2129 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1741  hypothetical protein  70.49 
 
 		 628 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  954    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1031  hypothetical protein  36.93 
 
 		 570 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1759  hypothetical protein  27.56 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 969 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.83 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  28.75 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  25.88 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  27.72 
 
 		 437 aa  53.5  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.87 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  27.38 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.67 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0221  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  27.08 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.5 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  27.63 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.6 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.04 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.5 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  33.66 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  25.64 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  26.25 
 
 		 440 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.7 
 
 		 1004 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 442 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  26.74 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.16 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  24.64 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.1 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  25.93 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.46 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.17 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.42 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.95 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  24.12 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  27.54 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  25.9 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2496  hypothetical protein  46.97 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1599  Arylsulfotransferase  35.63 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  27.57 
 
 		 1111 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 432 aa  47  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  23.44 
 
 		 567 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.08 
 
 		 729 aa  47  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 430 aa  47  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.65 
 
 		 1888 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  25.49 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1005 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  26.38 
 
 		 763 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.49 
 
 		 1010 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.24 
 
 		 1042 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.12 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.71 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  26.26 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.41 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.95 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.51 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.94 
 
 		 1028 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.68 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  26.56 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.29 
 
 		 720 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.7 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.46 
 
 		 667 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.9 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  23.56 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>