230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1538 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  97.42 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  47.59 
 
 		 326 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  47.57 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  45.95 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5054  hypothetical protein  49.03 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  48.87 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  47.59 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  45.81 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4277  hypothetical protein  47.57 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4033  hypothetical protein  46.6 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.671915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4333  hypothetical protein  46.6 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  45.69 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3749  hypothetical protein  46.28 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0605  hypothetical protein  46.77 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4223  hypothetical protein  46.28 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825511  normal  0.514911 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1829  hypothetical protein  46.77 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.580374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3190  hypothetical protein  46.6 
 
 		 310 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0862  hypothetical protein  46.77 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1122  hypothetical protein  46.45 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7701  hypothetical protein  44.69 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6069  hypothetical protein  45.02 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1700  hypothetical protein  45.31 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4256  hypothetical protein  45.31 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011054  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3578  hypothetical protein  43.69 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1601  hypothetical protein  43.55 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0966  hypothetical protein  44.01 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2337  hypothetical protein  45.81 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1036  hypothetical protein  45.81 
 
 		 310 aa  244  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2597  protein of unknown function DUF849  46.28 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  45.98 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0956  hypothetical protein  42.26 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4531  hypothetical protein  44.16 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.244191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1056  hypothetical protein  45.66 
 
 		 310 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4648  hypothetical protein  44.16 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5291  hypothetical protein  43.55 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  44.37 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  43.73 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3905  hypothetical protein  43.69 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.251797 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  42.26 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2185  hypothetical protein  43.51 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2778  hypothetical protein  45.31 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2660  hypothetical protein  45.81 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3694  protein of unknown function DUF849  45.31 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0426  hypothetical protein  43.93 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4641  hypothetical protein  44.66 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.719101  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4704  hypothetical protein  43.55 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1172  hypothetical protein  44.3 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0471  hypothetical protein  43.73 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2854  hypothetical protein  43.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2897  hypothetical protein  44.34 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3093  hypothetical protein  43.23 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.615612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2304  hypothetical protein  41.5 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3076  hypothetical protein  42.58 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  38.24 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3777  hypothetical protein  40.51 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5047  hypothetical protein  38.33 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.38 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  37.01 
 
 		 275 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  35.62 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  38.28 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  34.31 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  37.95 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.7 
 
 		 271 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.96 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  37.62 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  31.39 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  35.53 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  35.2 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33.44 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  33.64 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  30.43 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  32.68 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  32 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  30.75 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2170  hypothetical protein  34.63 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  32.21 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  32.04 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.1 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  31.37 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2202  hypothetical protein  33.11 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.491469 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.25 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2433  protein of unknown function DUF849  34.1 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  29.84 
 
 		 449 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3262  hypothetical protein  33.44 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  29.6 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3203  hypothetical protein  31.37 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  30.92 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  31.91 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  31.6 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.66 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  29.06 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  29.25 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5318  hypothetical protein  31 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>