285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1594 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 508 aa  1021    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  58.04 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  51.18 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1335  histidine ammonia-lyase  51.35 
 
 		 528 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.863562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  51.09 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  51.68 
 
 		 523 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  53.65 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  53.43 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  51.5 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  53.11 
 
 		 509 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  56.36 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  49.67 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  56.14 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  55.7 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  54.45 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  46.61 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11158  histidine ammonia-lyase  49.58 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  46.53 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  50.33 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  49 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  48.18 
 
 		 518 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  45.73 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  45.63 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  47.46 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  48.25 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  51.13 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  47.69 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  49.35 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  48.74 
 
 		 513 aa  402  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  48.17 
 
 		 507 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  47.22 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  47.91 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  47.97 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  49.46 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  46.06 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  48.72 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  45.64 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  50 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  46.71 
 
 		 508 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  45.49 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  47.93 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  47.61 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  44.21 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  46.07 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  47.69 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  46.47 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  47.69 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0149  histidine ammonia-lyase  46.72 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  48.12 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  47.9 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  47.69 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  45.9 
 
 		 507 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  48.56 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  46.1 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  47.4 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1689  histidine ammonia-lyase  49.34 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  47.62 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  49.55 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  48.06 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  46.91 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  46.91 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  46.1 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 533 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  44.79 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  46.7 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  42.68 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  46.34 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  45.18 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  47.66 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  50.9 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  45.4 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00727  histidine ammonia-lyase  48.94 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.396834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  48.55 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  45.34 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  43.85 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  49.47 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  47.12 
 
 		 506 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  46.02 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  46.06 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  46.35 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  46.62 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  49.88 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26290  histidine ammonia-lyase  49.45 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663417  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  45.2 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2855  histidine ammonia-lyase  47.3 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1264  histidine ammonia-lyase  50.69 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  46.11 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  46.49 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>