55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0284 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1382    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  56.67 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.95 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  37.98 
 
 		 520 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  46.43 
 
 		 615 aa  90.9  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  48.11 
 
 		 287 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  50 
 
 		 554 aa  87.4  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  45.79 
 
 		 763 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  42.99 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1162 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  36.51 
 
 		 797 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  49.35 
 
 		 990 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  43.27 
 
 		 668 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  41.3 
 
 		 152 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.86 
 
 		 851 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  46.15 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  45.1 
 
 		 896 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  42.31 
 
 		 578 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  37.96 
 
 		 844 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  42.05 
 
 		 1270 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  38.78 
 
 		 997 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  37.72 
 
 		 966 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 		 2324 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  37.37 
 
 		 258 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  37.07 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  42.35 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  39.74 
 
 		 931 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  34.21 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  39.29 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  36.89 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  44.19 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  33.73 
 
 		 1061 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.02 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  38.54 
 
 		 902 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  35.79 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  36.36 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  35.06 
 
 		 908 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 489 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1106 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  28.18 
 
 		 426 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  26.44 
 
 		 565 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  34.18 
 
 		 685 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  30.77 
 
 		 748 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  34.18 
 
 		 689 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  30.12 
 
 		 305 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.21 
 
 		 430 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  32.91 
 
 		 568 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  43.08 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1215 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  32.18 
 
 		 527 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1010 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>