155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6106 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 
216 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  97.22 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  81.86 
 
 
216 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  72.69 
 
 
216 aa  348  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  71.03 
 
 
214 aa  332  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  77.2 
 
 
206 aa  332  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  77.2 
 
 
206 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  73.1 
 
 
211 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  70.42 
 
 
212 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  72.5 
 
 
211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  72.22 
 
 
214 aa  322  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  64.25 
 
 
211 aa  303  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  60.49 
 
 
210 aa  274  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  60.2 
 
 
215 aa  271  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.5 
 
 
211 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  50.7 
 
 
229 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  57.35 
 
 
232 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  56.1 
 
 
217 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  55.56 
 
 
202 aa  245  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  54.07 
 
 
218 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  53.59 
 
 
218 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  54.63 
 
 
208 aa  242  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  58.59 
 
 
212 aa  241  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  52.4 
 
 
218 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  52.4 
 
 
218 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  52.4 
 
 
218 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  58.46 
 
 
211 aa  237  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  53.62 
 
 
211 aa  236  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  53.62 
 
 
211 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  53.77 
 
 
211 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  53.61 
 
 
216 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  55 
 
 
214 aa  234  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  53.62 
 
 
211 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  50.75 
 
 
219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  51.87 
 
 
213 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  48.77 
 
 
235 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  55.26 
 
 
199 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.33 
 
 
221 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  54.59 
 
 
205 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  56.22 
 
 
212 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  53.57 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  49.06 
 
 
214 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  50.25 
 
 
223 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  48.73 
 
 
224 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  45.97 
 
 
214 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  45.97 
 
 
214 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  45.97 
 
 
214 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  49.74 
 
 
238 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  57.89 
 
 
179 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  44.39 
 
 
217 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  37.5 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  35.03 
 
 
251 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  34.52 
 
 
244 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  34.01 
 
 
251 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  35.08 
 
 
278 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.93 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  36.31 
 
 
207 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  31.61 
 
 
269 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  33.5 
 
 
244 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.51 
 
 
270 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  30.81 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  33.83 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  31.75 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  34.59 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  32.98 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.4 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  30.48 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  32.77 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  32.29 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  31.28 
 
 
280 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  33.51 
 
 
273 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  29.9 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.61 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  32.98 
 
 
273 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  29.03 
 
 
287 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  30.05 
 
 
300 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  30.65 
 
 
277 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  28.34 
 
 
283 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  27.56 
 
 
248 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  27.86 
 
 
245 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  27.86 
 
 
241 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  27.96 
 
 
307 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  27.91 
 
 
245 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  27.05 
 
 
242 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.08 
 
 
781 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  27.96 
 
 
307 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  27.96 
 
 
307 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  29.35 
 
 
281 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  26.67 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  28.5 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  27.8 
 
 
239 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  25.35 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  27.41 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  29.21 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  24.88 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>