144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5770 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5770  response regulator receiver protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5902  response regulator receiver and SARP domain protein  55.66 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  40.79 
 
 		 847 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  39.47 
 
 		 847 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.96 
 
 		 847 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.16 
 
 		 844 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 472 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1618  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.18 
 
 		 846 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  33.33 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  34.48 
 
 		 852 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.64 
 
 		 481 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.55 
 
 		 875 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 1111 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  27.07 
 
 		 273 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.01 
 
 		 704 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 631 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  38.96 
 
 		 844 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  27.1 
 
 		 376 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  29.6 
 
 		 227 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2207  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.52 
 
 		 653 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576072 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  30.63 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  31.51 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.04 
 
 		 849 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  28.33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  30.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1275  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 472 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0891685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.89 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.94 
 
 		 651 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.17 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  30.7 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  30.89 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1936  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.941096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3751  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  31.87 
 
 		 441 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  30.56 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6406  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.58 
 
 		 252 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2354  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.97 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  29.66 
 
 		 856 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.46 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.08 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 454 aa  43.9  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  43.9  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.71 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1345  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 230 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.65 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 591 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 1096 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2718  two component signal transduction response regulator  28.67 
 
 		 467 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 183 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.08 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.63 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  30.08 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  32.11 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  32.46 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.26 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  25.42 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2156  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  33.33 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  28.91 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  33.83 
 
 		 232 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1195 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  28.21 
 
 		 230 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2256  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.54 
 
 		 262 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.596319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 		 906 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 		 855 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  32.82 
 
 		 233 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2775  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.84 
 
 		 258 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 		 856 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 523 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>