More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3654 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3352  glycogen debranching enzyme GlgX  93.02 
 
 		 659 aa  1271    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3764  glycogen debranching enzyme GlgX  65.54 
 
 		 649 aa  863    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2744  glycogen debranching enzyme GlgX  63.4 
 
 		 654 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 658 aa  1348    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1654  isoamylase  55.27 
 
 		 588 aa  594  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  48.89 
 
 		 1410 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  44.41 
 
 		 738 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.26 
 
 		 738 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  44.39 
 
 		 716 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  42.49 
 
 		 688 aa  505  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.99 
 
 		 723 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.92 
 
 		 733 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.92 
 
 		 733 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  45.29 
 
 		 704 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 720 aa  495  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.77 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.77 
 
 		 733 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 		 733 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  43.14 
 
 		 716 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  43.14 
 
 		 716 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  45.14 
 
 		 695 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.97 
 
 		 727 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  43.34 
 
 		 719 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 735 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.48 
 
 		 745 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  44.98 
 
 		 704 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.68 
 
 		 727 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 755 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  44.81 
 
 		 695 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  41.1 
 
 		 752 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.44 
 
 		 704 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 752 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  44.68 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.08 
 
 		 720 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  44.15 
 
 		 757 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  43.64 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  43.44 
 
 		 720 aa  482  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  46.53 
 
 		 661 aa  482  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  43.55 
 
 		 755 aa  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 752 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 710 aa  482  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  43.66 
 
 		 717 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 717 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  44.12 
 
 		 704 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  43.86 
 
 		 704 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 758 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 717 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  43.04 
 
 		 779 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 758 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  43.66 
 
 		 717 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  44.32 
 
 		 1464 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  43.35 
 
 		 729 aa  475  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  43.59 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  41.82 
 
 		 708 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  43.87 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.05 
 
 		 700 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  43.89 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  44.81 
 
 		 657 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  45.09 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  39.61 
 
 		 750 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.93 
 
 		 719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  44.11 
 
 		 694 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  43.4 
 
 		 708 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  44.93 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  40.68 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5877  glycogen debranching enzyme GlgX  41.58 
 
 		 718 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  40.8 
 
 		 715 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  43.19 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  44.27 
 
 		 694 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  45.09 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  45.09 
 
 		 658 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.28 
 
 		 751 aa  472  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  44.93 
 
 		 658 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  44.2 
 
 		 703 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  41.07 
 
 		 720 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  40.51 
 
 		 718 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 		 718 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 756 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 702 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  40.35 
 
 		 704 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  42.65 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  40.44 
 
 		 733 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  43.78 
 
 		 739 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 		 721 aa  465  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  40.55 
 
 		 710 aa  465  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  44.84 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.16 
 
 		 721 aa  462  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.51 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  40.14 
 
 		 706 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.24 
 
 		 712 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 702 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.18 
 
 		 714 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  40.18 
 
 		 714 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>