More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2738 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  82.05 
 
 		 156 aa  267  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 171 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  53.28 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  47.48 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  52.31 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 146 aa  140  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3114  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  49.31 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  48.23 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  48.23 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  49.63 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  47.83 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  47.79 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  49.63 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  46.1 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  45.32 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  49.28 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.86 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  45.58 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.86 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.86 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  45.99 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  52.34 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  43.92 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  47.92 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.9 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  45.71 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  44.6 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>