More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6062 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
104 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  91.35 
 
 
104 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  84.62 
 
 
104 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  85.44 
 
 
108 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  82.69 
 
 
104 aa  175  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  79.81 
 
 
104 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  73.79 
 
 
103 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  59.62 
 
 
104 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  53.4 
 
 
103 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3513  regulatory protein ArsR  43.56 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
107 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.38 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  41 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  41.41 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  45.65 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5249  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  44.94 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.73 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  29.9 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.54 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  38.95 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.76 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  29 
 
 
108 aa  67  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
115 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34.38 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>