More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5074 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5074  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
403 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131911  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  39.71 
 
 
391 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  40.18 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  38.48 
 
 
386 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.65 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  37.35 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.54 
 
 
401 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.39 
 
 
400 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  36.75 
 
 
397 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.77 
 
 
390 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  39.41 
 
 
403 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 
381 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.35 
 
 
398 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  37.92 
 
 
394 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  36.51 
 
 
390 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  38.05 
 
 
398 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  40.12 
 
 
388 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  37.35 
 
 
397 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 
377 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.57 
 
 
398 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  34 
 
 
399 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 
392 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 
389 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 
398 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.11 
 
 
383 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  36.92 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  37.05 
 
 
389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  38.91 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  38.91 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  38.91 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  39.16 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  37.79 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  38.89 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  39.88 
 
 
388 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  39.12 
 
 
406 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  35.93 
 
 
393 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 
393 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  37.27 
 
 
418 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  39.51 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  38.07 
 
 
381 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.54 
 
 
378 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  35.51 
 
 
382 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.43 
 
 
378 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.7 
 
 
407 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 
426 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 
393 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  34.24 
 
 
393 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  36.83 
 
 
379 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 
397 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 
394 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 
396 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  35.95 
 
 
379 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.72 
 
 
377 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2601  Cystathionine gamma-synthase  44.24 
 
 
390 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.04 
 
 
392 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.94 
 
 
400 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 
400 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  30.28 
 
 
390 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  37.24 
 
 
434 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 
408 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 
405 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.7 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  34.83 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.61 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  34.53 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.53 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.25 
 
 
411 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  34.69 
 
 
386 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  33.94 
 
 
393 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  36.89 
 
 
378 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  31.91 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.88 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.42 
 
 
377 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.42 
 
 
377 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  38.18 
 
 
426 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.05 
 
 
402 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  37.61 
 
 
426 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  37.13 
 
 
377 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  35.26 
 
 
383 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  36.47 
 
 
373 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  39.34 
 
 
380 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  32.66 
 
 
380 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  36.25 
 
 
390 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 
377 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.44 
 
 
390 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 
377 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4085  cystathionine beta-lyase  38.25 
 
 
397 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131173  normal  0.238155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 
377 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  37.54 
 
 
381 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  39.35 
 
 
403 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21181  putative cystathionine gamma-synthase  37.2 
 
 
389 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.12 
 
 
377 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  33.14 
 
 
413 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  33.81 
 
 
392 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  32.37 
 
 
388 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>