More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1959 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  94.27 
 
 		 314 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  60.06 
 
 		 321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  46.2 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 372 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 372 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  36.25 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  27.3 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  29.83 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  27.03 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  27.03 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  27.27 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  24.1 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.48 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  32.01 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  28.39 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  26.5 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29.83 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.44 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  28.47 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.23 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  29.49 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  26.18 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  30.51 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  30.51 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.19 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.56 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  29.25 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.67 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  30.51 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.84 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.67 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.05 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.45 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  28.79 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.35 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  27.57 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  30.74 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.63 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  30 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  28.14 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  29.9 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  29.12 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  30.03 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  29.63 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.47 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.42 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.46 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  27.24 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.08 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  27.24 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  29.45 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.42 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.42 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.08 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  27.24 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.42 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  29 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  27.87 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  28.81 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  27.41 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>