More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1103 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  93.52 
 
 		 463 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 463 aa  949    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  67.87 
 
 		 470 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  65.81 
 
 		 466 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  42.36 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  38.36 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  38.09 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  40.24 
 
 		 460 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  38.72 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  38.3 
 
 		 463 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  37.22 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  38.04 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  36.03 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  37.53 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  35.82 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  37.13 
 
 		 468 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  36.92 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  35.76 
 
 		 490 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.41 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  36.64 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  36.64 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  31.92 
 
 		 476 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  32.25 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  32.25 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.81 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 508 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  30.21 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  32.2 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  33.18 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  32.35 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  31.63 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.42 
 
 		 511 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.5 
 
 		 498 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.48 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.68 
 
 		 546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.2 
 
 		 554 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.2 
 
 		 554 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.51 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.51 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  28.31 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.73 
 
 		 546 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  29.61 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.51 
 
 		 549 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.16 
 
 		 527 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.32 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.3 
 
 		 551 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.45 
 
 		 478 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  28.1 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.23 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.73 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.33 
 
 		 506 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  26.5 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  26.4 
 
 		 483 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  24.83 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.87 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.79 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  27.36 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  26.57 
 
 		 705 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  30.72 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  30.72 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.32 
 
 		 592 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.27 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  27.7 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  29.74 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  28.22 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1132  multicopper oxidase, type 2  28.63 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  27.91 
 
 		 490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.92 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89638  Multicopper oxidase  25.73 
 
 		 626 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.951464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  24.49 
 
 		 513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  30.45 
 
 		 547 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  34.56 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.44 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.25 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  25.39 
 
 		 570 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.06 
 
 		 569 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  25.24 
 
 		 746 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  25.45 
 
 		 568 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  24.09 
 
 		 513 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  25.2 
 
 		 556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  36.19 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   24.09 
 
 		 631 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.18 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.17 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25.45 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  24.34 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  24.38 
 
 		 561 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.4 
 
 		 532 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  25.6 
 
 		 664 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.95 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.95 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  26.62 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  25.15 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>