284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3883 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 369 aa  753    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  68.02 
 
 		 365 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  70.54 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  66.07 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  63.5 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  64.69 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  63.22 
 
 		 350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  63.74 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  64.2 
 
 		 382 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  66.37 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  62.36 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  63.2 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  64.67 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  62.07 
 
 		 365 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  60.86 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  58.09 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  57.8 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  59.34 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  61.03 
 
 		 350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  60.24 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  61.79 
 
 		 359 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  61.68 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  60.81 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  60.81 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  64.9 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  60.81 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  61.16 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  59.53 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  60.52 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  57.31 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  67.51 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  62.88 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  61.08 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  56.25 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  54.9 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  54.76 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  56.47 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  56.93 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  56 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  49.27 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  52.07 
 
 		 340 aa  345  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  49.28 
 
 		 353 aa  333  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.91 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.91 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.64 
 
 		 345 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.38 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 324 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.46 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.66 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.5 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.32 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.97 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  36.93 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 325 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.19 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 329 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.09 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.37 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.7 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  35.27 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.36 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.47 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  30 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.64 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.13 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  31.84 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>