268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0976 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 323 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  50.16 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  50.47 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  47.78 
 
 		 333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  48.41 
 
 		 345 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  48.42 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  47.04 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  47.06 
 
 		 321 aa  298  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  48.15 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  46.91 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  46.93 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  44.97 
 
 		 319 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  39.14 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.89 
 
 		 323 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  35.89 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  38.41 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  36.73 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  36.16 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  36.39 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  35.37 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  36.67 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  38.93 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  34.37 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.83 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  36.51 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  36.42 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.39 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  38.49 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  35.08 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  36.68 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  35.4 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.81 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.75 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.06 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.41 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  37.55 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  32.8 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.23 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.35 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.71 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  33.54 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.31 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  34.8 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 326 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.85 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.84 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.55 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  34.2 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.1 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  33.23 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.76 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  32.57 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  32.3 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  33.77 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.71 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.71 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.78 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.77 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>