More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6387 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  72.59 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  73.53 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  73.53 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  73.53 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  67.65 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  67.65 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  60.31 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  36.92 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  39.09 
 
 		 207 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  39.09 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  39.09 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  38.89 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  38.89 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  38.4 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  42.71 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  37.27 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.62 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  42.27 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  35.65 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  34.38 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  36.94 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>