More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5652 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  100 
 
 
433 aa  863    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  74.29 
 
 
432 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  70.73 
 
 
432 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  69.98 
 
 
432 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  71.36 
 
 
432 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  75.18 
 
 
437 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5023  major facilitator transporter  59.08 
 
 
436 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3811  major facilitator transporter  60 
 
 
436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  0.313558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4653  major facilitator transporter  60 
 
 
436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114552  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5654  major facilitator transporter  58.85 
 
 
436 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3710  major facilitator transporter  60 
 
 
436 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3594  major facilitator transporter  59.31 
 
 
436 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5441  major facilitator transporter  59.08 
 
 
436 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0868687  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1228  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  57.8 
 
 
436 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5038  major facilitator superfamily MFS_1  60.91 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1619  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  60.42 
 
 
431 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  54.48 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 
444 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  54.78 
 
 
430 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  54.4 
 
 
444 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  52.42 
 
 
443 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  50.48 
 
 
428 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  51.94 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 
450 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  52.35 
 
 
445 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  47.71 
 
 
442 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  50.62 
 
 
439 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  47.48 
 
 
437 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  50.84 
 
 
437 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  48.9 
 
 
441 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  52.74 
 
 
443 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  49.88 
 
 
440 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  50.84 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  48.66 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  51.57 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  47.98 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  48.41 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  48.31 
 
 
441 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  48.31 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  48.66 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  49.76 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  52.3 
 
 
442 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  49.29 
 
 
433 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  46.19 
 
 
440 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 
441 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  49.2 
 
 
435 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 
444 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 
439 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  49.01 
 
 
441 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  47.06 
 
 
440 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  49.29 
 
 
433 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  48.34 
 
 
459 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  47.06 
 
 
440 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 
441 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4698  major facilitator transporter  45.48 
 
 
440 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140204  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  46.12 
 
 
440 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  47.95 
 
 
469 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  48.91 
 
 
443 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  47.51 
 
 
454 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  47.64 
 
 
445 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  47.7 
 
 
435 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  50.36 
 
 
434 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  51.42 
 
 
444 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  50.12 
 
 
440 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  50.12 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  47.95 
 
 
440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  49.88 
 
 
434 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  47.73 
 
 
443 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  47.95 
 
 
440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  47.95 
 
 
440 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  47.95 
 
 
440 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  47.95 
 
 
440 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  50.12 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  48.24 
 
 
439 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  50.12 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  47.72 
 
 
424 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  46.62 
 
 
469 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  48.54 
 
 
441 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 
439 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 
430 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  48.49 
 
 
444 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  50.61 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  46.24 
 
 
437 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  47.69 
 
 
444 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  50.99 
 
 
437 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  48.83 
 
 
454 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.65 
 
 
439 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  48.67 
 
 
445 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 
445 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  47.02 
 
 
436 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  47.02 
 
 
436 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  47.13 
 
 
433 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  47.62 
 
 
436 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  49.26 
 
 
441 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
435 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  46.14 
 
 
451 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  45.37 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  45.22 
 
 
452 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 
433 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  47.75 
 
 
426 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.150061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>