More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2879 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2879  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3079  LysR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0627  transcriptional regulator, LysR family  57.43 
 
 		 295 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.133406  normal  0.406767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4073  LysR family transcriptional regulator  56.61 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3809  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.22688  hitchhiker  0.00755616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4358  transcriptional regulator, LysR family  54.79 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0352  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3463  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4630  transcriptional regulator, LysR family  53.79 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4698  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.981446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4176  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5490  LysR family transcriptional regulator  54.45 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3575  LysR family transcriptional regulator  54.45 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4792  LysR family transcriptional regulator  54.45 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0919  LysR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0718  LysR family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1156  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 367 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4409  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1144  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0785  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6616  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  32.7 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4400  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3907  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.05 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4369  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5814  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0678  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  0.525189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2656  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  34.94 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  31.77 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  28.77 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1770  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal  0.0253433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>