More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0718 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0718  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4630  transcriptional regulator, LysR family  57.19 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3079  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0352  LysR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0627  transcriptional regulator, LysR family  51.1 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.133406  normal  0.406767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4358  transcriptional regulator, LysR family  50.18 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4073  LysR family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2879  LysR family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3809  LysR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.22688  hitchhiker  0.00755616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3463  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 305 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5490  LysR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3575  LysR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4792  LysR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4698  LysR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.981446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4176  LysR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0919  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  32.49 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.74 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  31.34 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  31.34 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4400  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0274  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  31.64 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  30.94 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  31.64 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  31.64 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>