More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0198 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  37.98 
 
 		 1160 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  37.98 
 
 		 1160 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0832  DNA polymerase III subunit alpha  35.24 
 
 		 1237 aa  680    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  44.78 
 
 		 1170 aa  890    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  39.62 
 
 		 1155 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  36.44 
 
 		 1174 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  34.87 
 
 		 1228 aa  658    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  40.59 
 
 		 1149 aa  767    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  36.42 
 
 		 1165 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3107  DNA polymerase III subunit alpha  37.36 
 
 		 1191 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438164  normal  0.971034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  37.6 
 
 		 1108 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  36.15 
 
 		 1200 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  36.34 
 
 		 1200 aa  662    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  37.98 
 
 		 1160 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  36.64 
 
 		 1158 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  35.78 
 
 		 1173 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  37.79 
 
 		 1108 aa  684    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  37.6 
 
 		 1108 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  37.79 
 
 		 1108 aa  685    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  36.81 
 
 		 1157 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  35.28 
 
 		 1148 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  35.37 
 
 		 1148 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  36.05 
 
 		 1173 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  38.31 
 
 		 1177 aa  751    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  39.22 
 
 		 1172 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0047  DNA polymerase III subunit alpha  37.77 
 
 		 1188 aa  722    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.55181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  39.13 
 
 		 1172 aa  784    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  35.96 
 
 		 1164 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  36.85 
 
 		 1180 aa  717    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  36.35 
 
 		 1174 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  38.35 
 
 		 1160 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  36.1 
 
 		 1173 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  37.87 
 
 		 1160 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  39.98 
 
 		 1156 aa  751    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  36.38 
 
 		 1157 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  36.31 
 
 		 1201 aa  687    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  40.61 
 
 		 1172 aa  804    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  36.21 
 
 		 1165 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  41.32 
 
 		 1172 aa  817    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  39.71 
 
 		 1155 aa  780    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  38.6 
 
 		 1165 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  35.74 
 
 		 1203 aa  674    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  37.79 
 
 		 1108 aa  684    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  36.01 
 
 		 1186 aa  667    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  39.27 
 
 		 1165 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3636  DNA polymerase III subunit alpha  36.5 
 
 		 1183 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  37.98 
 
 		 1160 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  39.33 
 
 		 1165 aa  805    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  44 
 
 		 1156 aa  871    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  35.91 
 
 		 1185 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  39.9 
 
 		 1210 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4082  DNA polymerase III subunit alpha  36.59 
 
 		 1183 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4168  DNA polymerase III subunit alpha  36.64 
 
 		 1249 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  36.38 
 
 		 1157 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  35.66 
 
 		 1173 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  39.27 
 
 		 1165 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  39.47 
 
 		 1217 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  36.77 
 
 		 1159 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  41.15 
 
 		 1171 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  36.5 
 
 		 1168 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  38.89 
 
 		 1157 aa  739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  35.8 
 
 		 1176 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11580  DNA polymerase III subunit alpha  37.85 
 
 		 1184 aa  710    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  35.85 
 
 		 1163 aa  648    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  39.82 
 
 		 1159 aa  784    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1538  DNA polymerase III subunit alpha  37.27 
 
 		 1213 aa  673    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3087  DNA polymerase III subunit alpha  37.36 
 
 		 1191 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.11 
 
 		 1165 aa  792    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  37.13 
 
 		 1155 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  86.79 
 
 		 1279 aa  2242    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  35.38 
 
 		 1194 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  37.44 
 
 		 1158 aa  672    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  37.19 
 
 		 1158 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  37.19 
 
 		 1158 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  37.91 
 
 		 1182 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  37.3 
 
 		 1109 aa  691    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  41.51 
 
 		 1130 aa  796    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  39.71 
 
 		 1181 aa  834    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1272 aa  2609    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  35.82 
 
 		 1173 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1581  DNA polymerase III subunit alpha  36.79 
 
 		 1185 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  36.13 
 
 		 1143 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  39.8 
 
 		 1164 aa  798    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  38.53 
 
 		 1195 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  37.11 
 
 		 1158 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  38.24 
 
 		 1190 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1238  DNA polymerase III subunit alpha  36.68 
 
 		 1331 aa  660    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.93 
 
 		 1184 aa  759    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  43.32 
 
 		 1225 aa  841    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3050  DNA polymerase III subunit alpha  35.14 
 
 		 1183 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  37.9 
 
 		 1157 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3147  DNA polymerase III subunit alpha  37.36 
 
 		 1191 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480917  normal  0.366201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  37.91 
 
 		 1157 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2777  DNA polymerase III subunit alpha  37.19 
 
 		 1182 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91865  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  37.17 
 
 		 1162 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  39.72 
 
 		 1175 aa  757    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.88 
 
 		 1170 aa  897    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  36.66 
 
 		 1200 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  37.56 
 
 		 1183 aa  657    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  39.09 
 
 		 1165 aa  802    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>