194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1566 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  73.27 
 
 		 202 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  73.27 
 
 		 202 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  75.37 
 
 		 203 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  74.38 
 
 		 203 aa  277  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  74.88 
 
 		 203 aa  274  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  49.17 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  49.14 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  46.7 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  45.3 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  49.17 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  43.01 
 
 		 235 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  46.01 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  45.71 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  49.41 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  42.72 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  37.09 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  39.47 
 
 		 267 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  37.19 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  32.7 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  28.64 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2023  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.81 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  30.59 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  30.52 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  30.95 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  31.54 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  29.15 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  39.18 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.85 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  26.9 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  32.58 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  28.75 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  31.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  28.75 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  28.75 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.97 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  28.75 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  30.2 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  30.77 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  29.66 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  29.73 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  28.75 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  31.29 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  30.77 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  34.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  34.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  30.15 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  33.04 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  34.21 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  30.77 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  38.78 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.03 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  30.39 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  26.15 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  28.38 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  25.57 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  31.11 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  32.14 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  30.07 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  37.14 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  29.79 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  28.57 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  26.52 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  28.89 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  27.55 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  28.37 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  22.73 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  26.15 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  26.15 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  22.53 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  28.37 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  33.65 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  23.63 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  31.07 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.88 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  28.57 
 
 		 206 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  29.86 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  25.84 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2860  cytochrome c oxidase subunit III  41.46 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  30.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  30.22 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  28.45 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.18 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>