83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3110 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  100 
 
 		 352 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  78.73 
 
 		 362 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  79.01 
 
 		 362 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  58.31 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  56.93 
 
 		 336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  44.57 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  43.7 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  44.44 
 
 		 372 aa  258  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  44.44 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  44.44 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  44.41 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  44.44 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  44.44 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  44.41 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  44.69 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  43.43 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  43.43 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  44.78 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  43.72 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  42.86 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  42.9 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  43.3 
 
 		 577 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  42.93 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  39.48 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  38.15 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  37.42 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  34.21 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  33.23 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  34.88 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  33.43 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  31.56 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  33.24 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.45 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  33.44 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  34.33 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  34.09 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  30.15 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  29.43 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  29.19 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  28.08 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  37.04 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  32.04 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  31.8 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  28.93 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  26.35 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  25.8 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  26.35 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  25.51 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.27 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  25.63 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.6 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  24.85 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.62 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  26.43 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  31.84 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  24.77 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  26.83 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  25.07 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25.07 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  22.32 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  29.66 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  25.5 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  23.08 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  26.14 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  24.25 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  22.36 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  26.44 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  26.75 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  23.23 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.94 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  24.91 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  25.19 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  28.67 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  28.49 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  25.95 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  26.55 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  21.86 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  35.63 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>