99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2375 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  84.75 
 
 		 223 aa  358  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  84.75 
 
 		 223 aa  358  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  56.89 
 
 		 217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  53.15 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  52.22 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.42 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.42 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  47.22 
 
 		 205 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  48.22 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.43 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.19 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.86 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.23 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.23 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.23 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.12 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.63 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  44.22 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.72 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.65 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.63 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.63 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.63 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.22 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  43.43 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  45.23 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.38 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.48 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  40.49 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.58 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  37.22 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.38 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.08 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.82 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.39 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  32.16 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  39.18 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.31 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  48.06 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.73 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.84 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.79 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  37.31 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.45 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.37 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  28.12 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.24 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.13 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.68 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.82 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  29.61 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.49 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.7 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.98 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.88 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.89 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.76 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.36 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.83 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.44 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.24 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.31 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.37 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.58 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.8 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.51 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  23.45 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.71 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.95 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.41 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 936 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.35 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.26 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.17 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.92 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1506  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2077  hypothetical protein  27.86 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.79 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.9 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  27.66 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.77 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0212  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.107215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  26.09 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.76 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.22 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0115942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  28.79 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.64 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.08 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.08 
 
 		 252 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.5 
 
 		 229 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.14 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  26.92 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>