134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2284 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2284  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5153  protein of unknown function DUF159  77.55 
 
 		 196 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.631725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5255  hypothetical protein  73.98 
 
 		 196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.601003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3104  hypothetical protein  48.5 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  41.21 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  39 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  38.69 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  38.19 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2283  hypothetical protein  34.96 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5154  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.616671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.82 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.38 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3283  hypothetical protein  26.74 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.232935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  24.88 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3953  hypothetical protein  28.88 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  29.91 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.6 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  33.09 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  34.48 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.02 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.65 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  26.34 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  30.33 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  30.23 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  26.85 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  27.98 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  28.41 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  26.7 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  30.47 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.48 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  26.56 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  33.05 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.2 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.37 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0010  hypothetical protein  24.79 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  27.53 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  25.11 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  25.48 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  29.84 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  26.45 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  29.17 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  27.87 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  26.54 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  28.45 
 
 		 337 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  28.95 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3340  hypothetical protein  27.49 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3808  protein of unknown function DUF159  24.7 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  31.18 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  51.2  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  28.32 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  29.13 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  23.58 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  24.42 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1568  hypothetical protein  26.06 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000595888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  26.32 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  28.81 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  28.14 
 
 		 388 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  30.25 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.46 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  31.86 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  26.38 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  26.54 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1551  protein of unknown function DUF159  33.04 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0992681  normal  0.026854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  26.53 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3995  hypothetical protein  25.56 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1134  protein of unknown function DUF159  24.6 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  27.48 
 
 		 247 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  25.66 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  26.01 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  24.52 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3296  hypothetical protein  27.81 
 
 		 244 aa  47.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.543717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.7 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  26.44 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  32.71 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  33.04 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  28.26 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  27.35 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  24.88 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  28.32 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3372  hypothetical protein  29.59 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  25.68 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  30.77 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  25.53 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  28.07 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  29.41 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  26.92 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  27.73 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0200  hypothetical protein  26.15 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.189466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>