97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1488 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1488  flagellin  100 
 
 		 735 aa  1387    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  63.25 
 
 		 746 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  60.37 
 
 		 753 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  60.77 
 
 		 762 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  81.41 
 
 		 737 aa  1134    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  61.65 
 
 		 888 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  60.82 
 
 		 888 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  60.57 
 
 		 892 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  58.35 
 
 		 886 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  60.75 
 
 		 886 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.21 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  54.05 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  66.06 
 
 		 528 aa  326  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  48.79 
 
 		 536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  59.12 
 
 		 514 aa  303  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  50.12 
 
 		 537 aa  303  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  58.53 
 
 		 516 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  57.94 
 
 		 522 aa  296  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  47.58 
 
 		 1562 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  54.24 
 
 		 405 aa  190  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  53.39 
 
 		 405 aa  190  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  54.24 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  52.97 
 
 		 405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  44.37 
 
 		 630 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  43.89 
 
 		 620 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  51.27 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  53.18 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  46.69 
 
 		 397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  37.57 
 
 		 578 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  51.96 
 
 		 399 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  50.84 
 
 		 399 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.41 
 
 		 420 aa  163  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  43.62 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  54.49 
 
 		 375 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  50.84 
 
 		 399 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.88 
 
 		 400 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  41.57 
 
 		 393 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  57.48 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  56.45 
 
 		 692 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  42.56 
 
 		 300 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  42.51 
 
 		 272 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  40.12 
 
 		 272 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  41.32 
 
 		 272 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  39.52 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.92 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.32 
 
 		 272 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  40.72 
 
 		 275 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  42.59 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  34.76 
 
 		 289 aa  94  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  43.16 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  35.15 
 
 		 273 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  35.54 
 
 		 273 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  35.71 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  30.64 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  29.58 
 
 		 320 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  30.14 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  30.69 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  29.27 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  28.86 
 
 		 320 aa  57.4  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  30.56 
 
 		 292 aa  57  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  30.19 
 
 		 301 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.43 
 
 		 274 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  28.75 
 
 		 320 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  30.66 
 
 		 301 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  29.95 
 
 		 302 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  37.63 
 
 		 395 aa  55.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  29.65 
 
 		 302 aa  54.7  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  24.57 
 
 		 321 aa  54.3  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  41.67 
 
 		 389 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  28.4 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  35.48 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  24.41 
 
 		 321 aa  52.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  37.66 
 
 		 395 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  28.24 
 
 		 277 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  40.28 
 
 		 311 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.98 
 
 		 275 aa  51.6  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.76 
 
 		 302 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.43 
 
 		 303 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  28.09 
 
 		 293 aa  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  29.56 
 
 		 272 aa  47.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  35.11 
 
 		 320 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  35.11 
 
 		 439 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  26.97 
 
 		 282 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  36.99 
 
 		 303 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  35.56 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  37.63 
 
 		 494 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  32.17 
 
 		 327 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  36.11 
 
 		 380 aa  45.4  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  29.82 
 
 		 281 aa  45.8  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  38.36 
 
 		 592 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  36.99 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.82 
 
 		 277 aa  45.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  36.99 
 
 		 461 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  31.67 
 
 		 590 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  37.68 
 
 		 279 aa  44.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  29.59 
 
 		 282 aa  44.3  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  31.68 
 
 		 282 aa  44.3  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>