More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0178 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  100 
 
 		 159 aa  313  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  84.28 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  76.67 
 
 		 160 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  74.83 
 
 		 159 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  70.97 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  66.88 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  84.62 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  65.14 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 367 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 371 aa  111  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  67.86 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  54.72 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  46.38 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 342 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 227 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  55 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  57.14 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 221 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55.21 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  64.1 
 
 		 124 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 116 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 358 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 324 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  59.77 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  53.33 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  54.22 
 
 		 204 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 203 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 203 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  60 
 
 		 120 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 266 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  61.04 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 198 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 171 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  58.23 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 202 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.43 
 
 		 124 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 206 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  39.19 
 
 		 139 aa  90.5  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 124 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  54.02 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.69 
 
 		 206 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  54.02 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 196 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.49 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 137 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 238 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.65 
 
 		 211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  60.81 
 
 		 122 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 274 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 335 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  53.33 
 
 		 274 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>